شبیه سازی جمعیت اولیه (تاریخی) و تعیین صحت عدم تعادل پیوستگی در مطالعات شبیه سازی ژنومی

Authors

حسین مهربان

اردشیر نجاتی جوارمی

سید رضا میرایی آشتیانی

حسن مهربانی یگانه

abstract

جهت بررسی صحت عدم­تعادل پیوستگی در مطالعات شبیه­سازی ژنومی، جمعیتی در دو حالت عدم­تعادل پیوستگی صفر و یک در نسل اول شبیه سازی شد. از معیارهای اندازه مؤثر جمعیت، میزان عدم­تعادل پیوستگی و واریانس بین نشانگرها جهت تعیین صحت شبیه­سازی استفاده شد. نتایج نشان دهنده همبستگی بالا بین اندازه مؤثر جمعیت مشاهده شده و مورد انتظار بود. همچنین میزان عدم­تعادل پیوستگی مشاهده شده و مورد انتظار بر هم منطبق شدند و چنین روندی با افزایش اندازه جمعیت مؤثر وضعیت مطلوب تری پیدا کرد. به­علاوه میزان واریانس مشاهده شده و مورد انتظار بین نشانگرها در حالت نوترکیبی آزاد نیز بر یکدیگر منطبق شدند. با توجه به معیارهای مورد بررسی می توان گفت که جمعیت اولیه به درستی شبیه­سازی شده است و می­توان از آن برای توسعه جمعیت مرجع استفاده کرد. با توجه به نتایج به­دست آمده پیشنهاد می­شود در مطالعات شبیه­سازی ژنومی پس از تشکیل جمعیت اولیه از معیارهای ارائه داده شده جهت بررسی صحت شبیه­سازی استفاده شود.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

شبیه سازی فرآیند نمونه سازی بدنه خودرو

شبیه سازی فرایند نمونه سازی بدنه خودرو همواره مورد توجه خودروسازان بوده است و هریک به نوعی به این قضیه نگاه کرده اند دراین روش ابرنقاط تهیه شده از قطعات بجای خود آنها توسط نرم افزاربصورت مجازی مونتاژ می شوند وآنالیز و بررسی های لازم که شامل موارد زیر می شود در زمانی بسیارکوتاهتروبا هزینه ای به مراتب کمترصورت می گیرد : -          آنالیز انطباقات ٬ درزها و عدم همسطحی ها. -           شبیه سازی ج...

full text

صحت سنجی عملکرد شبیه های گردش عمومی جو (AOGCM) در شبیه سازی داده های دما در منطقه ی کرمان

تغییرات ‌اقلیمی در قرن بیست و یکم مهم‌ترین چالش پیش روی جوامع بشری است. نهادهای پژوهشی بسیاری در سراسر دنیا، شبیه‌های گوناگونی را بمنظور پیش بینی اقلیم و فراسنج های آن ارایه نموده اند. عدم اطمینان ناشی از کاربرد شبیه‌های گوناگون گردش عمومی جو‌ (AOGCM) سبب شد که در این پژوهش به عنوان هدف اصلی, نتایج شبیه‌های گردش عمومی جو در شبیه سازی فراسنج های اقلیمی برای سال‌های آماری پایه مورد بررسی قرار گرف...

full text

بررسی ژنومی ساختار جمعیتی و عدم تعادل پیوستگی در برخی از نژاد‌های گوسفند بومی ایران

فن‌آوری‌های ژنومی مانند تعیین ژنوتیپ با کارایی بالا بر اساس آرایه‌های SNP، پتانسیل بالایی برای رمزگشایی معماری ژنتیکی صفات پیچیده دارد و اطلاعات زمینه‌ای در مورد ساختار ژنوم در حیوانات اهلی، از قبیل میزان عدم تعادل پیوستگی (LD) فراهم می‌کند. در این پژوهش، از آرایه ژنومیIllumina Ovine SNP50K BeadChip برای تخمین و مقایسه عدم تعادل پیوستگی، اندازه مؤثر جمعیت (Ne) و هتروزیگوسیتی در سه جمعیت گوسفند ...

full text

شبیه سازی در آموزش پرستاری

  مقدمه: شبیه‌سازی، نسخه­ای از بعضی وسایل حقیقی یا موقعیت­های کاری است که تلاش دارد، بعضی جنبه­های رفتاری سیستمی فیزیکی یا انتزاعی را به‌وسیله رفتار سیستم دیگری نمایش دهد . هدف اصلی از کاربرد شبیه­سازی در مراقبت­های بهداشتی، آماده­سازی دانشجویان برای مواجهه با موقعیت‌های بالینی است که امنیت بیمار را افزایش، خطاها را کاهش و قضاوت­های بالینی پرستاران را بهبود می­دهد. این روش از پیچیدگی زیاد یادگی...

full text

روش ترکیبی شبیه سازی زمانی و BCU جهت تعیین پایداری

در این مقاله روش ترکیبی شبیه سازی زمانی و BCU1 به منظور بررسی پایداری گذرای سیستم های قدرت به روش تابع انرژی گذرا (TEF)2 در چهارچوب مرجع مرکز اینرسی(COI)3 ارائه می شود. در روش BCU از مرز پایداری یک سیستم کاهش یافته که تنها در زیر فضای زاویه تعریف می گردد به عنوان تقریبی محلی از مرز پایداری سیستم اصلی استفاده می شود به طوریکه تقریب مرز پایداری سیستم کاهش یافته ساده تر می باشد. برای این منظور اب...

full text

My Resources

Save resource for easier access later


Journal title:
دوفصلنامه فن آوری زیستی در کشاورزی(علمی-پژوهشی)

Publisher: دانشگاه بوعلی سینا

ISSN 1735-7446

volume 5

issue 2 2015

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023